제80회 인코세미나 Offline - 미생물 Whole Genome Sequencing 데이터 기반 균주 타이핑 및 역학 분석
지원 일정
2026-09-30 ~ 2026-10-15
교육기간
2026-10-23
13:00 ~ 16:00
13:00 ~ 16:00
준비사항
개인 노트북, 필기구, 노트, 기타 개인 물품
강의 개요
미생물 Whole Genome Sequencing 데이터 기반 균주 타이핑 및 역학 분석
이번 인코세미나에서는 CLC Genomics Workbench와 Microbial Genomics Module을 활용한 미생물 Whole Genome Sequencing(WGS) 데이터 분석 과정을 소개합니다. 실제 미생물 데이터를 기반으로 원시 리드 전처리부터 균주 동정, MLST 타이핑, 항생제 내성 유전자 분석, 샘플 오염 확인, K-mer Tree와 SNP Tree 기반의 집단발생 클러스터 분석까지 직접 수행합니다. 또한 분석 결과와 메타데이터를 연계해 계통수에 시각화하고, 기존 분석 결과와 비교하며 생물학적·역학적 의미를 해석하는 방법을 안내합니다. 발표자료와 실습용 데이터 세트가 제공되며, 미생물 WGS 데이터를 다루거나 CLC 솔루션의 실제 활용 방법을 익히고 싶은 연구자에게 적합한 과정입니다.
강의 구성
다음과 같은 내용을 배울 수 있습니다.
WGS 기반 균주 타이핑 및 항생제 내성 유전자 분석 방법 습득
워크플로우를 활용하여 상동성이 높은 참조 유전체 탐색과 균주 동정, NGS 기반 MLST 타이핑, 항생제 내성 유전자 데이터베이스를 활용한 내성 유전자 검출을 한 번에 수행하는 방법을 학습할 수 있습니다.
K-mer Tree 및 SNP Tree 기반 분석 방법 이해
K-mer Tree로 분석 대상 균주에 적합한 공통 유전체를 선정하고, Compare Variants Across Samples를 통해 SNP Tree와 SNP Matrix를 생성하여 균주 간 유연관계와 클러스터를 판별하는 방법을 학습할 수 있습니다.
커리큘럼
13:00 ~ 13:30 CLC Microbial Genomics Module 소개 및 미생물 WGS 분석 개요 13:30 ~ 13:45 실습 데이터, 메타데이터 Import 및 소개 13:45 ~ 14:25 활용 분석 도구 및 워크플로우 소개 & 실습(Type Among Multiple Species) 14:25 ~ 14:35 휴식 14:35 ~ 15:00 분석 결과 검토 및 샘플 오염 검출 실습 15:00 ~ 15:20 K-mer Tree 생성 및 참조 유전체 선정 실습 15:20 ~ 15:50 Compare Variants Across Samples 실습 15:50 ~ 16:00 분석 결과 최종 해석 및 Q&A
강의 특징
강의 특징을 소개해 드려요.
오프라인 강의 진행
인실리코젠의 전문 컨설턴트가 준비한 솔루션 사용 방법과 팁, 케이스 스터디를 만나보세요.
전문 컨설턴트의 다양한 강의
튜토리얼, 기능소개, 케이스 스터디 등 다양한 콘텐츠 제공으로 연구자가 스스로 분석하고 인사이트를 얻을 수 있도록 지원합니다.
실습 교육 및 개별 컨설팅 제공
실습 교육과 함께 인실리코젠의 전문 컨설턴트가 개별 컨설팅을 제공합니다.
강사소개
생물정보 컨설턴트팀을 소개합니다.
iLAB
인실리코젠의 생물정보 컨설턴트는 BI 전문지식의 공유를 통해 고객에게 최적의 연구 환경을 제시하고 있습니다. 생물정보와 관련한 전문지식과 기술 공유를 통해 국내에 많은 연구자가 직접 생물정보 분석을 수행할 수 있도록 하는 iLAB 만의 솔루션 활용 방법에 대한 교육을 만나보세요.